魅族MX3此次搭载了Flyme 3.0系统，该系统基于Android 4.2.1，界面设计风格更加简洁，线条化明显，色彩清淡典雅。如果仔细与Flyme 2.0对比，你会发现Flyme 3.0图标风格极尽简化，之前的阴影、光晕效果明显淡化，“图库”icon的差异可以很好地展现这样的改变。另外，整体图标取色都较为柔和，所以即使色彩多样，也不会觉得繁杂错乱。放弃拟物和复杂光影效果，似乎是目前多数手机厂商达成的共识，这一点从MIUI V5和iOS 7都已经走在了前面。

Flyme 3.0界面依旧为横屏滑动，支持多个分页，此次分页标记改为英文字母(此前是窄短的横杠)，并且更为突出。可以通过直接点击某一分页进行快速跳转。而另一个优势则在于程序图标位置的改变，此前的系统界面如果打算将第一屏的应用挪至第六屏，需要按住图标在屏幕边缘苦苦等待分页切换，Flyme 3.0则只需要将程序图标放置在下方的所需分页字母标识上即可。

另外一点，魅族终于放下了浏览器的“高贵的身价”，在Flyme 3.0中浏览器图标与其他应用毫无区别，支持拖拽和移动，甚至放到文件夹中。而此前，屏幕中间的黄金位置一直强制被浏览器“霸占”，这个圆形图标加上魅族的标志几乎让绝大多数人在一开始误以为是主菜单键，并且久久难以适应。

如果说以上几点变化过于细微，那么分页支持上下滚动绝对是Flyme 3.0的最大变化。我们把界面分页滑动方向比作X轴，难么Flyme 3.0上下滚动则为Y轴。Y轴由于不限制图标数量，完全可以用一屏显示所有图标及桌面控件，而不需要在X轴上面进行延展。

针对分页的问题，我们也对周边用户进行了简单调查。大多数用户的分页数量习惯保持在3页以内，也就是说无论分页支持7屏或是9屏，真正对于用户所在意的就是主屏以及主屏左右各一屏，在这3个分页内，放置了几乎90%的常用功能。所以Flyme 3.0增加分页上下滚动对于不少用户来说可以放一屏之内放置更多内容，但是系统强制显示除主页外的A、B两个分页有些莫名其妙，也就是说即使将AB两个分页上的内容全部移开，空白页面依旧存在。